加急见刊

肺癌中SOX4基因的调控网络分析验证和蛋白质预测

李明阳; 马春霞; 吴翰欣; 吴小海; 俞建昆 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所中心实验室; 云南昆明650118; 昆明医科大学附属第二医院; 云南昆明650118

摘要：目的：分析SOX4基因的调控网络和蛋白产物特征,并进行验证。方法：利用生物信息学方法预测人SOX4基因的调控网络及其蛋白产物与其他蛋白的相互作用;在肺癌细胞系和肺癌临床样本中通过实时荧光定量PCR对mi RNA-30s进行定量分析。结果：人类SOX4蛋白可能与TP53、DICER1和SDCBP2等3种蛋白相互作用;SOX4基因可能受多种lnc RNA和mi RNA的调控;hsa-mi R30s在临床样本中表达模式不完全相同。与癌旁组织相比,hsami R30c-5p和hsa-mi R30d-5p在癌组织中显示低表达,hsa-mi R30d-5p则相反;与正常人胚肺成纤维细胞KMB17相比,肺癌细胞系A549和H1299中3个mi RNA-30成员的表达模式均为高表达。结论：SOX4基因及其蛋白产物的生物信息学分析为相关研究提供了重要信息基础,但尚须相关实验验证,以确定相关性。

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