丹苘软胶囊干预大鼠非酒精性脂肪肝细胞模型基因芯片的组学分析
摘要：目的:通过筛选mRNA(Clariom^TM S Assay)芯片及miRNA芯片的显著差异性基因,预测microRNA相关靶基因,探究丹苘软胶囊改善肝细胞脂肪代谢的调控机制。方法:提取丹苘软胶囊灌胃SD大鼠的含药血清,并对BRL大鼠肝细胞取对数生长期细胞进行实验,以阴性对照血清做对照,提取细胞总RNAs,采用Clariom S表达谱芯片及microRNA芯片检测细胞mRNA及miRNA的表达水平。运用生物信息学方法预测miRNA的靶基因,对脂肪代谢相关基因进行富集分析和通路分析。结果:经筛选和预测得到5629个预测靶基因参与20种生物学过程,7种细胞成分,有20种分子作用,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路被富集;rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p为调控网络中心;IPA数据库共检出31个与实验有关的脂肪代谢基因。结论:丹苘软胶囊在治疗非酒精性脂肪肝(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的机制可能与rno-miR-26b-5p、rno-miR-129b-5p、rno-miR-21b-5p,神经营养素信号通路、丙型肝炎、PI3K-Akt信号通路相关性较高。
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