加急见刊

DEL cDNA序列分析及蛋白质三维结构的模建

庄乃保 张印则 吴凡 邵超鹏 苏晓东 深圳市血液中心 深圳518035 北京大学 北京100000

摘要：目的 分析DEL血型的cDNA序列,模拟并分析DEL血型蛋白质三维结构.方法 采用逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）技术和cDNA序列分析技术,得到DEL血型的cDNA序列并测序分析.通过同源比较模建（Homology comparative modeling）的思想,构建和分析正常阳性RHD和DEL9两种蛋白质的三维结构.结果 DEL血型个体有复杂的mRNA形式,共检测到6种形式的RhD转录子.DEL血型不存在正常的RhD mRNA.对正常RHD和与正常RHD序列相似度最高的DEL9蛋白质结构进行比较分析.结构显示DEL9蛋白属于α螺旋结构蛋白,其在膜外部分与正常RhD蛋白基本一致.结论 DEL血型可能具有正常RhD的抗原表位.

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