金针菇小G蛋白Ran的序列特征与表达分析
摘要：基于金针菇（Flammulina velutipes）基因组和转录组数据，运用本地BLAST方法，找到一个小G蛋白Ran的编码基因，命名为FvRan1。运用生物信息学方法进行分析，结果显示：该基因全长为1337bp，编码区长度为1079bp，包含7个外显子和6个内含子，其中4个内含子（11、12、13、16）在mRNA加工过程中存在可变剪切现象。通过氨基酸序列同源比对和系统发育分析发现，FvRanl具有5个G-Box保守结构域和2个效应器开关，与担子菌中Moniliophthora roreri以及Trametes versicolor的亲缘关系最近。采用RT-qPCR研究FvRan1在不同生长时期及部位、伸长期菌柄的不同部位以及竖直、微重力（旋转）、水平3个不同处理条件下的表达量，结果表明，FvRan1在成熟期菌柄中的表达量最高；在金针菇伸长区段的表达量显著高于生长点和非伸长区段；在模拟微重力条件下，FvRan1呈显著上调表达。FvRan1基因在金针菇菌柄伸长与重力应答过程中可能具有正调控作用。
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系食用菌学报杂志社
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