烟草疫霉SSR分子标记的开发与初步应用
摘要：为开发烟草疫霉的SSR分子标记,利用MISA软件搜索烟草疫霉基因组序列中的SSR位点,共发现1311个SSR位点,优势SSR位点为二核苷酸和三核苷酸,分别占总SSR位点的56.45%和39.36%;根据分析到的SSR位点使用Primer 5.0软件设计48对SSR引物,以7株烟草疫霉的DNA为模板对这些引物进行筛选,共获得扩增条带清晰且具有多态性的SSR引物20对,然后使用其中的6对SSR对32株烟草疫霉进行UPGMA聚类分析,遗传相似系数在0.60~1.00之间,在相似系数0.70水平上,可将其划分为3个类群,类群Ⅰ包含29个菌株,类群Ⅱ包含1个菌株,类群Ⅲ包含2个菌株,显示出较低的遗传分化水平。这些SSR引物的开发将为研究我国烟草疫霉的遗传多样性、群体遗传结构以及遗传图谱构建等奠定基础。
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系植物病理学报杂志社
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