加急见刊

母源性长链非编码RNA Six2a-OT参与斑马鱼胚胎发育调控

景新星; 宋佳坤; 范纯新 上海海洋大学海洋生物系统和神经科学研究所; 中国上海201306; 海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室; 中国上海201306; 水产科学部级实验教学示范中心; 中国上海201306; 水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心; 中国上海201306

摘要：Six基因家族进化高度保守,在脊椎动物个体发育中起着重要作用。但目前对其调控机制尚不完全清楚。在UCSC （The University of California Santa Cruz） Genome Browser的斑马鱼基因组数据库中发现, Six2a-Six3a基因簇周围存在一条长链非编码RNA——Six2a-OT。首先,利用反转录PCR （RT-PCR）结合测序证实了该RNA确实存在。然后,利用荧光半定量PCR （qPCR）和整胚原位杂交（whole-mount in situ hybridization, WISH）确定了其特异性的表达模式：Six2a-OT在卵巢中的表达远高于精巢;在受精卵和早期原肠胚中高表达,随后显著下降;受精后48 h （48 hpf）集中表达于耳囊（otic vesicle）、躯干中线（trunk midline）和鳃弓（branchial archs）。随后,进一步利用反义吗啡啉（morpholino）特异性阻断Six2a-OT剪接,观察到63%的48 hpf胚胎表现出躯干变短、侧弯,或心包积水,同时Six2a和Six3a的表达显著下降。以上结果表明：Six2a-OT作为母源性因子通过调节Six2a和Six3a的表达参与斑马鱼胚胎早期发育。这为揭示Six基因簇的表达调控机制提供了重要依据。

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