Gateway技术构建菊芋块茎全长cDNA文库及EST测序分析
摘要：为丰富菊芋功能基因组学研究基础平台,以成熟期菊芋块茎为材料,将菊芋全长cDNA与Gateway供体载体pDONR222重组,构建了菊芋非剪切型全长cDNA文库。文库质量分析表明：未经扩增的原始文库库容量为5.76×10 6 CFU,插入片段大小主要为1～3000 bp,重组率为100%（24/24）,达到了高质量文库的标准。利用该文库进行表达序列标签（expressed sequence tag, EST）测序,得到2639条高质量的EST序列,拼接后获得1895条非重复的唯一表达序列（unigene）。与NCBI的NR数据库同源比对分析表明,共有1533条unigene（80.9%）与已知基因有显著的同源性。GO分类结果显示：菊芋块茎表达基因在分子功能类群中,结合和催化活性所占比例最高。此cDNA文库将可用于菊芋功能基因组研究、新基因筛选、高通量EST测序以及菊芋cDNA芯片的制备等。
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系生命科学研究杂志社
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