肾透明细胞癌基因表达谱芯片的生物信息学分析
摘要：目的 利用生物信息学的方法分析肾透明细胞癌（ccRCC）相关基因功能富集、通路及关键基因的临床意义。方法 从TCGA和GEO下载ccRCC的RNA测序数据和芯片数据，利用R语言筛选出差异基因。然后利用metascape进行通路和功能富集，利用STRING 网站和 Cytoscape 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，同时从PPI网络中筛选出关键基因。最后利用OncoLnc网站对CCL5、TYROBP、LILRB2和MMP9做生存分析。结果 总共筛选出660个差异基因，这些差异基因与白细胞迁移、细胞黏附调节和免疫应答正调节等通路密切相关。在PPI网络中，得到两个意义显著的功能模块和15个关键基因。在这15个关键基因中，CCL5、TYROBP、LILRB2和MMP9表达的高低与ccRCC患者的生存率明显相关。结论 通过对ccRCC基因表达谱芯片的生物信息学分析发现，CCL5、TYROBP、LILRB2和MMP9基因可能在ccRCC的发生发展过程中起重要作用。
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系现代泌尿生殖肿瘤杂志社
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