多鳞鱚不同组织荧光定量PCR内参基因筛选
摘要：【目的】筛选多鳞鱚（Sillago sihama）雌雄不同组织中稳定表达的内参基因。【方法】应用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术定量分析多鳞鱚snrpd1、rps27、rpl7a、rpl7、cnpb、rps4、rps20、ef1a、ube2、rplp2等10个候选内参基因m RNA在雌、雄个体脑、鳃、性腺、心、肠、肾、肝、肌肉、皮肤、脾、胃等22个组织中的表达水平,通过BestKeeper、NormFinder、GeNorm工具测评10个内参基因表达的稳定性。【结果】10个候选内参基因均可获得特异性的扩增产物和理想的扩增效率,其中Bestkeeper软件计算候选内参基因稳定性由高到低的顺序为：snrpd1=rps27〉 rpl7a〉 rpl7〉cnpb=rps4〉 rps20〉 ef1a〉 ube2〉 rplp2;Norm Finder软件分析结果为：rpl7〉rpl7a〉 rps27〉 rps4〉 cnpb〉 ef1a〉 rps20〉 ube2〉 rplp2〉 snrpd1;Ge Norm软件分析结果为：rpl7/rpl7a〉 rps4〉ef1a〉 rps27〉 rps20〉 cnpb〉 ube2〉 rplp2〉 snprd1。【结论】rpl7、rpl7a、rps27基因的表达稳定性较高,建议选择rpl7和rpl7a共同作为多鳞鱚q RT-PCR研究的内参基因。
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系广东海洋大学学报杂志社
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