橄榄CaICE1基因的克隆和表达分析
摘要：为了解橄榄（Canarium album）抗寒相关转录因子 ICE1的调控功能,采用 RT-PCR 技术克隆了‘福榄 1 号’的 ICE1,命名为 CaICE1,并进行生物信息学、qRT-PCR 表达模式和相关 miRNA预测分析.结果表明,CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为 1 650 bp,可编码549个氨基酸（GenBank登录号 MG459422）.CaICE1 为不稳定亲水性蛋白质,含有跨膜结构、磷酸化位点以及 HLH 保守结构域,定位于细胞核,与枳的 ICE1 亲缘关系较近.CaICE1 密码子偏好性较弱,AGA、AGG、TGG和 CCA可能为其最优密码子群.CaICE1 主要在橄榄花、种子和叶中大量表达,-3℃低温胁迫下 CaICE1 表达水平比常温显著上升. psRNAtarget 预测结果表明, CaICE1 可能是 miR825、 miR477、 miR5658、 miR1436 和miR394 等多个逆境响应 miRNA的靶基因.因此,CaICE1 可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用,且可能受 miRNA的调控.
注: 保护知识产权,如需阅读全文请联系热带亚热带植物学报杂志社
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