加急见刊

大鼠脊髓损伤后脊髓组织中上调差异基因的生物信息学分析

钟占琼; 薛清彩; 易晓红; 黄聪; 于海艳; 刘伟伟; 陈继兰; 夏军; 张晓 成都中医药大学基础医学院; 四川成都市611137; 成都医学院基础医学院; 四川成都市610500

摘要：目的探究大鼠脊髓损伤后脊髓组织中差异表达的上调基因及功能。方法采用改良Allen法制备雌性Sprague-Dawley大鼠脊髓损伤模型,应用基因芯片技术检测在大鼠脊髓损伤后脊髓中差异基因的变达,运用基因本体论和基因组百科全书数据库分析差异上调基因、功能定位与通路。结果脊髓组织总核糖核酸质量检测结果合格;基因芯片检测结果显示上调差异基因1874个,下调差异基因2348个;生物信息学分析上调差异基因的生物学过程、细胞组分和分子功能,涉及凋亡、免疫反应、炎症等,通路分析主要涉及磷脂酰肌醇三激酶-蛋白激酶B信号通路和Toll样受体信号通路等。结论脊髓损伤后,上调差异表达基因可能参与脊髓损伤后的继发性反应,如炎症、免疫应答、缺氧等,继而影响脊髓损伤后的运动功能和感觉功能。

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