加急见刊

基于生物信息学分析和预测人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子

张蕊; 吴启洋; 刘纪明; 郭晓仪; 吴龙火 赣南医学院药学院制药工程教研室; 江西赣州341000; 赣南医学院; 江西赣州341000

摘要：目的:通过生物信息学软件分析和预测在人骨肉瘤中能够靶向结合Gab2的miRNA。方法:首先通过生物信息学软件mir Walk 2. 0预测可以靶向结合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的热力学稳定性评分和序列保守性评分。并通过人骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差异表达的miRNA。在生物信息学软件打分较高的miRNA中选出差异表达的miRNA,从而选出人骨肉瘤中能与Gab2结合的特异性最强,稳定性最高的miRNA。结果:mir Walk 2. 0预测有22个miRNA可与Gab2靶向结合;其中,miR-1236-3p、miR-218-5p与Gab2结合的稳定性和特异性最好;在人骨肉瘤中差异表达的miRNA有184个,而miR-218-5p的表达也存在差异性,并且表达下调。结论:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向结合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因。

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