加急见刊

植物乳杆菌WCFS1和JDM1的糖代谢PPI网络鲁棒性研究

孙凯传; 苗孟君; 杨斌 滁州学院计算机与信息工程学院; 安徽滁州239000; 中国移动通信集团安徽公司滁州分公司; 安徽滁州239000

摘要:由于生长环境不同,植物乳酸杆菌WCFS1和JDM1的糖代谢存在差异。为研究两者糖代谢差异,本文利用复杂网络理论,构建植物乳酸杆菌WCFS1和JDM1糖代谢的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)网络。通过研究两者糖代谢PPI网络的鲁棒性,发现在随机攻击、度攻击、介数攻击三种方式下, WCFS1的柠檬酸循环模块、戊糖磷酸途径模块的PPI网络的鲁棒性优于JDM1,较JDM1有较强的容错性。此外,发现WCFS1和JDM1的糖代谢PPI网络受介数高的节点影响较大。

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